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Etude de la diversité génétique de Mycoplasma agalactiae : plasticité des génomes, mobilome et dynamique de surface

Nouvel, Laurent-Xavier (2009) Etude de la diversité génétique de Mycoplasma agalactiae : plasticité des génomes, mobilome et dynamique de surface. (Study of Mycoplasma agalactiae genetic diversity : genomic plasticity, mobilome and dynamic of surface components.)

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Abstract

Mycoplasma agalactiae est responsable de l'agalactie contagieuse, maladie des petits ruminants difficilement contrôlée et figurant sur la liste de l’OIE. Afin d’évaluer la diversité génétique de ce pathogène, 101 isolats ont été comparés par trois techniques (VNTR, RFLP, répertoire vpma). Les résultats révèlent une grande homogénéité génétique dont la souche type PG2 est représentative. Quelques isolats font exception telle la souche 5632 que nous avons séquencée et analysée ici. La comparaison des génomes et des protéomes entre 5632 et PG2 indiquent que la plasticité de ces génomes est liée à d’importants échanges d'ADN et à la présence de nombreux éléments génétiques mobiles (10% du génome). Ces analyses révèlent également une forte dynamique au sein de répertoires de gènes codant des protéines de surfaces. Pour les mycoplasmes, bactéries minimales dépourvues de paroi, ces évènements ont certainement joués un rôle dans leur survie et leur adaptation à des hôtes complexes. ABSTRACT : Mycoplasma agalactiae is responsible of contagious agalactia, a disease of small ruminants that is still difficult to control and is listed by the OIE. In order to evaluate the genetic diversity of this pathogen, 101 isolates were compared using three techniques (VNTR, RFLP, vpma repertoire). Results revealed a high genetic homogeneity with the PG2 type strain as representative. Some isolates however diverged such as the 5632 which was sequenced and analysed here. Whole comparative genomic and proteomic analyses of the 5632 and PG2 strains indicate that their genomic plasticity resides in important genes flux and in the presence of several mobile genetic elements (10% of the genome). These analyses also revealed that specific loci encoding repertoire of surface proteins are highly dynamic. For these minimal bacteria that lack a cell-wall, these events have most likely played a major role in their survival and adaptation to complex hosts.

Department or laboratory:Interactions Hôtes - Agents Pathogènes - IHAP (Toulouse, France)
Directeur de thèse:Citti, Christine
Uncontrolled Keywords:Mycoplasmes - Ruminants - Mycoplasma agalactiae - Diversité génétique - Marqueurs épidémiologiques - Eléments génétiques mobiles - Eléments intégratifs conjugatifs (ICE) - Séquences d'insertion (IS). KEYWORDS : Mycoplasmas - Ruminants - Mycoplasma agalactiae - Genetic diversity - Molecular epidemiology - Mobile genetic elements - Integrative conjugative elements (ICE)-Insertion sequences (IS)
Subjects:Biology > Molecular and cellular biology and genetics - Biotechnology
Biology > Biology, health, biotechnology
Biology
Deposited On:25 January 2010

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